Долгое время считалось, что его потребление способствует возникновению сердечно-сосудистых заболеваний. На самом деле статистика была искажена из-за того, что любители кофе являются, как правило, и курильщиками.
Если выделить из статистических данных другие показатели, в частности курение, то выясняется, что кофе не является вредным, если только речь не идет о кофе по-турецки. Привычка пить кофе по-турецки в некоторых районах Франции (например, на севере) приводит к увеличению уровня «плохого» холестерола в крови на 5-10%.
У некоторых людей, чувствительных к кофеину, кофе с кофеином может усилить гиперинсулинизм, в частности у тучных людей и диабетиков (по типу II).